Zanzibar leží v tropickom rovníkovom pásme, takže sa vyznačuje veľmi vysokými teplotami a minimálnymi teplotnými výkyvmi počas celého roka.
Podnebie je tropické, na pobreží je teplé a vlhké, zatiaľ čo vo vnútrozemí je horúce a suché. Priemerná teplota vzduchu sa počas roka pohybuje
od 26 do 33 °C, zatiaľ čo teplota mora neklesá pod 25 °C. Najteplejšie mesiace sú
od novembra do marca, zatiaľ čo chladnejšie mesiace sú od mája do septembra.